Para mejores resultados, se debe utilizar el WinRhizo con un escáner doble, lo que permite que las raíces estén iluminadas desde arriba y abajo durante la adquisición de la imagen. Esto se denomina "Dual Scan" en los manuales de WinRhizo, y reduce la formación de sombras en los imágenes de raíces. El sistema de colocación de las bandejas "Regent Positioning System" permite la colocación consistente de las bandejas, asi no hay que hacer una prevista de cada imagen antes del escaneo.
El escáner esta listo para tomar imágenes. Note la fuente de luz secundaria requerida para el modo "Dual Scan". La bandeja esta colocada con el "Regent Positioning System", una seria de espaciadores (rojos en este foto), permiten la colocación consistente de la bandeja.
Imagen de la pantalla de esta muestra de raices despues de escanearla a 200 dpi
La resolución optima depende en el tipo de muestra. Raíces de Phaseolus vulgaris se pueden escanear a 200-400 dpi en bandejas de 20 x 30 cm, mientras que raíces de Arabidopsis pueden requerir una resolución de 600 dpi en bandejas de 10 x 5 cm. Menor resolución reduce el tiempo requerido por cada imagen, especialmente con bandejas grandes. El análisis de longitud radical se hace con imágenes en escala de grises; si grabamos las imágenes así, se reduce el tamaño del archivo digital.