A disponibilidade de softwares Opensource é uma revolução na web. Opensource software é gratuito e encaixa no orçamento de qualquer um. Mas há mais razões para usar softwares opensource. A razão mais importante é a "dependência/fidelidade do consumidor". O quão dependente você se tornou do proprietário provedor de software? E se em alguns anos a companhia do software elimina o suporte para seu software ou os tipos de arquivos que você está usando? O processador de textos é um bom exemplo. Quem ainda pode ler os documentos WP5 de 15 anos atrás?

A ciência sempre teve uma característica de abertura ao conhecimento, isto é, o conhecimento deve ser livremente compartilhado. Os softwares Opensource encaixam nessa característica.

Há uma riqueza de ferramentas disponíveis, e um dos principais problemas para os pesquisadores pode ser por decidir qual das ferramentas utilizar. Portanto, eu decidi publicar minha lista de ferramentas. Aqueles interessados deveriam visitar este website: https://help.ubuntu.com/community/UbuntuScience

Ambiente de desenvolvimento integrado

Eu uso eclipse. Mas uma vez que eu não sou fã do programa Java estou considerando mudar para Anjuta. A versão mais nova parece realmente boa. Eu gosto do Gedit como editor.

Compiladores

gcc suit of compilers

Plataformas

ubuntu

Desktop

gnome

Estatística

R

Gráfico

grace (try version 6) faz gráficos muito bons para publicação, mas esse gui (Graphical User Interface) não é muito amigável e o desenvolvimento (melhoria) parece ter parado em grande parte. Atualmente eu goste do open office mais e mais para produção de gráficos. Ao contrário do Excel, você pode digitar as coordenadas, dimensionar o gráfico sem dimensionar o texto e a espessura da linha. Mas isso fica realmente bom quando você copia o gráfico no programa de desenho do open office. Quando o seu gráfico estiver quase pronto você pode quebrá-lo (segmentá-lo) e, então, ele se torna um desenho do vetor nativo (original) e, então, você pode editá-lo corretamente.

Visualizacao em 3D

Frewrl, (um programa para visualização em 3D) openscenegraph era meu programa, mas paraview supera tudo para mim agora.

office suit

open office - Eu acho o programa writer muito mais fácil e direto do que o Microsoft word. Especialmente o estilo é muito mais fácil de usar e tem menos comportamento inesperado 'de onde aquilo veio'. A planilha funciona bem com melhor controle sobre os gráficos. O ponto alto com o openoffice é que ele suporta a inclusão de arquivos eps. Assim, os desenhos dos vetores não perdem qualidade para impressão e eu posso usar lyx para criar boas tabelas rapidamente.

edição de fotos e análise de imagens

O gimp, imageJ

pôster

Eu tive que fazer um pôster e acabei usando inkscape. Isso funcionou muito bem. Eu fiz os gráficos no open office, e os converti em svg e então os importei para o inkscape. O resultado: um pôster baseado em vetor muito bom que imprime muito bem. Uma dica: quebre o gráfico no open office desenhe no desenho vetorial, dessa maneira é mais fácil editar no inkscape, e você não será afetado pelo bug de exportação svg, o qual processa textos invisíveis em gráficos porque o arquivo não é definido.

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