A disponibilidade de softwares Opensource é uma revolução na web. Opensource software é gratuito e encaixa no orçamento de qualquer um. Mas há mais razões para usar softwares opensource. A razão mais importante é a "dependência/fidelidade do consumidor". O quão dependente você se tornou do proprietário provedor de software? E se em alguns anos a companhia do software elimina o suporte para seu software ou os tipos de arquivos que você está usando? O processador de textos é um bom exemplo. Quem ainda pode ler os documentos WP5 de 15 anos atrás?
A ciência sempre teve uma característica de abertura ao conhecimento, isto é, o conhecimento deve ser livremente compartilhado. Os softwares Opensource encaixam nessa característica.
Há uma riqueza de ferramentas disponíveis, e um dos principais problemas para os pesquisadores pode ser por decidir qual das ferramentas utilizar. Portanto, eu decidi publicar minha lista de ferramentas. Aqueles interessados deveriam visitar este website: https://help.ubuntu.com/community/UbuntuScience
Ambiente de desenvolvimento integrado
Eu uso eclipse. Mas uma vez que eu não sou fã do programa Java estou considerando mudar para Anjuta. A versão mais nova parece realmente boa. Eu gosto do Gedit como editor.
Compiladores
Plataformas
Desktop
Estatística
Gráfico
grace (try version 6) faz gráficos muito bons para publicação, mas esse gui (Graphical User Interface) não é muito amigável e o desenvolvimento (melhoria) parece ter parado em grande parte. Atualmente eu goste do open office mais e mais para produção de gráficos. Ao contrário do Excel, você pode digitar as coordenadas, dimensionar o gráfico sem dimensionar o texto e a espessura da linha. Mas isso fica realmente bom quando você copia o gráfico no programa de desenho do open office. Quando o seu gráfico estiver quase pronto você pode quebrá-lo (segmentá-lo) e, então, ele se torna um desenho do vetor nativo (original) e, então, você pode editá-lo corretamente.
Visualizacao em 3D
Frewrl, (um programa para visualização em 3D) openscenegraph era meu programa, mas paraview supera tudo para mim agora.
office suit
open office - Eu acho o programa writer muito mais fácil e direto do que o Microsoft word. Especialmente o estilo é muito mais fácil de usar e tem menos comportamento inesperado 'de onde aquilo veio'. A planilha funciona bem com melhor controle sobre os gráficos. O ponto alto com o openoffice é que ele suporta a inclusão de arquivos eps. Assim, os desenhos dos vetores não perdem qualidade para impressão e eu posso usar lyx para criar boas tabelas rapidamente.
edição de fotos e análise de imagens
pôster
Eu tive que fazer um pôster e acabei usando inkscape. Isso funcionou muito bem. Eu fiz os gráficos no open office, e os converti em svg e então os importei para o inkscape. O resultado: um pôster baseado em vetor muito bom que imprime muito bem. Uma dica: quebre o gráfico no open office desenhe no desenho vetorial, dessa maneira é mais fácil editar no inkscape, e você não será afetado pelo bug de exportação svg, o qual processa textos invisíveis em gráficos porque o arquivo não é definido.