RootScan é um software de imagem designado para codificar características anatômicas de seções transversais de raízes obtidas em microscópio de imagens digitais
RootScan after anatomical features have been extracted and measured
RootScan é um programa Matlab desenvolvido para alto rendimento na fenotipagem de características anatômicas tais como aerênquima em raízes de milho. O artigo original descreve o software e seu uso para realizar o screening de características anatômicas radiculares.
"RootScan2" é uma aplicação do programa Java com características atualizadas, criadas em 2014 por Cleoniki Kesidis para o laboratório de Lynch/Brown, para análises semiautomáticas de imagens de seções transversais de raízes de milho geradas via ablação por laser. Melhorias para esse programa inclui habilidade para melhor detectar os limites entre o estelo e aerênquima, e identificação detalhada de fileiras de células corticais e saída/liberação de dados. Para usar RootScan2, download "RootScan2.jar" e certifique que você tem a última versão do Java. Código fonte pode ser disponibilizado sob solicitação. Versões adicionais de RootScan2 estão em andamento. As seguintes versões também estão disponíveis para download:
RootScan2 User Manual (PDF; requires Adobe Reader)
RS2 Video Tutorial 1 : Loading files (Videos are mp4 files.)
RS2 Video Tutorial 2 : Phase 1 analysis
RS2 Video Tutorial 3 : Saving files
RS2 Video Tutorial 4 : Phase 2 analysis
RS2 Video Tutorial 5 : Phase 3 analysis
PDF document, 12.3 MB
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