RootScan é um software de imagem designado para codificar características anatômicas de seções transversais de raízes obtidas em microscópio de imagens digitais

RootScan after anatomical features have been extracted and measured

RootScan after anatomical features have been extracted and measured

RootScan é um programa Matlab desenvolvido para alto rendimento na fenotipagem de características anatômicas tais como aerênquima em raízes de milho. O artigo original descreve o software e seu uso para realizar o screening de características anatômicas radiculares.

"RootScan2" é uma aplicação do programa Java com características atualizadas, criadas em 2014 por Cleoniki Kesidis para o laboratório de Lynch/Brown, para análises semiautomáticas de imagens de seções transversais de raízes de milho geradas via ablação por laser. Melhorias para esse programa inclui habilidade para melhor detectar os limites entre o estelo e aerênquima, e identificação detalhada de fileiras de células corticais e saída/liberação de dados. Para usar RootScan2, download "RootScan2.jar" e certifique que você tem a última versão do Java. Código fonte pode ser disponibilizado sob solicitação. Versões adicionais de RootScan2 estão em andamento. As seguintes versões também estão disponíveis para download:

RootScan2 User Manual (PDF; requires Adobe Reader)
RS2 Video Tutorial 1 : Loading files (Videos are mp4 files.)
RS2 Video Tutorial 2 : Phase 1 analysis
RS2 Video Tutorial 3 : Saving files
RS2 Video Tutorial 4 : Phase 2 analysis
RS2 Video Tutorial 5 : Phase 3 analysis

RootScan Users Manual

PDF document, 12.3 MB

RootScan Download (ZIP)

Zip archive, 1.4 MB