SimRoot

Esse simulador de sistema radicular tridimensional calcula absorção de água e nutrientes conforme as raízes crescem e recebem fotossintatos da parte aérea em um ambiente do solo em 3D.

Introducao

SimRoot é um modelador de arquitetura de raiz em 3D. Ele simula o crescimento do sistema radicular no tempo em um espaço virtual 3D e está associado a um modelo de solo 3D, que computa absorção de água e nutriente pelo uso de módulos funcionais. O crescimento é predefinido no SimRoot. Um número infinito de classes de raízes pode ser definido, cada uma com seu próprio padrão de crescimento e ramificação. Coleção de padrões de crescimento e ramificação leva tempo, mas é possível usando vários métodos apresentados nesse site, tais como estudos em vasos, avaliação de coroa e amostragem de raiz. Atualmente arquivos para estudos com milho e feijão estão disponíveis.

SimRoot - uma ferramenta para pesquisa

SimRoot nos permite estudar o efeito de características especificas em raízes relacionadas à aquisição de recursos. SimRoot tem um modelo configurado de carbono que nos permite estudar a economia de carbono (balanço de carbono) de plantas e um modelo de nutriente que nos permite estudar absorção de nutriente. Um modelo para água foi recentemente integrado na versão aberta do SimRoot (veja abaixo). Deste modo, com o SimRoot nós podemos estudar a importância de características de raiz sob restrição de múltiplos recursos.

Atualmente, nós conduzimos estudos simulados com Aerênquima em Córtex de Raiz - Root Cortical Aerenchyma (RCA), Senescência de Córtex de Raiz - Root Cortical Senescence (RCS), Densidade de Ramificação Lateral de Raiz - Lateral Root Branching Density(LRBD) e seus sinergismos com pelos radiculares, ângulos da raiz axial em milho, e estruturas complementares de raiz no sistema de cultivo das "três culturas irmãs" (milho, feijão e abobrinha/squash). Está sob investigação os benefícios do número reduzido de fileiras de células corticais - Cortical Cell File Number (CCFN) e tamanho ampliado de células corticais da raiz - enlarged root Cortical Cell Size (CCS) em milho sob estresse nutricional.

Fonte aberta da versão do SimRoot (OpenSimRoot)

OpenSimRoot - uma ferramenta de pesquisa que nos permite estudar o efeito de uma característica radicular específica na aquisição de recursos, de forma que podemos estudar a importância de uma característica sob restrição de múltiplos recursos.

Um benefício do OpenSimRoot é sua estrutura de programa modular. Ele é agora completamente C++ e baseia-se somente em bibliotecas padrões:

Johannes Postma: j.postma@fz-juelich.de

Christian Kuppe: c.kuppe@fz-juelich.de

A versão atual do SimRoot está disponibilizada no endereço GitLab.com. Ela é de livre acesso para programadores e usuários de vários institutos. Para acessar, favor contatar o seguinte pessoal: